ACADEMIC BACKGROUND

1. Name Surname

 : Yeşim AYIK

2. Date of Birth

 : 07.06.1995

3. Title

 : Arş. Gör.

Foreign Language Proficiency

Exam Type Score Exam Date
YÖKDİL 86 17.03.2018
YÖKDİL 82.5 13.03.2022

Contact Information

: yesim.ayik@uskudar.edu.tr

4. Educational Background

Degree Department University Year
BSc Biyomühendislik Üsküdar Üniversitesi 2018
MSc Biyomühendislik Yıldız Teknik Üniversitesi 2021
PhD Biyomühendislik Yıldız Teknik Üniversitesi

5. Academic Titles

Degree Department University Year

6. Supervised Theses

7. Publications

7.1. Papers published in internationally refereed journals (Scopus Indexed)

  1. BÜŞRA Y., RUKİYE G., YEŞİM A., OLIVER G., VİLDAN E. A., ESRA Ç., TUBA E., Effect of soybean protein isolate-Aronia melanocarpa extract interaction on the bioaccessibility of anthocyanins after low-pressure cold plasma treatment, Food chemistry: X, (2026), 37(), , .
  2. Atalay V. E., Ayık Y., Antioxidative activity analyses of some pyridazine derivatives using computational methods., Chemical Papers, (2019), 73(), 3105-3113, .

7.2. Papers published in other internationally peer-reviewed journals

  1. Ayik Y., Yilancioglu K., The serotonergic system in Alzheimer's Disease, The Journal of Neurobehavioral Sciences, (2018), 5(1), 37-42, .

7.3. Assertions presented in international scientific congresses and published in the proceedings

  1. GÜNEŞ D. B., AYIK Y., ARSLAN S., YILDIRIM Ş., SAKARYA D., ÖZEL C., YÜCEL S., Characterization of Therapeutic Metal-Ion-Doped And Undoped Bioactive Glasses Synthesized Using The Stöber Method, II. International Evliya Çelebi Scientific Studies Congress, (03.10.2026), Online
  2. Yapıcı E., Şereflioğlu Ş., Ayık Y., Yücel S., Synthesis of Calcium Phosphates from Oyster Shell Powder of a Cardiidae Species via Mechanochemical Precipitation, 13th International Conference on Materials Science and Nanotechnology for Next Generation (MSNG2026), (02.09.2026), Adıyaman / Türkiye
  3. Ayık Y., Özdemir M., Gündoğdu M., Emeç M., Atalay V. E., An Evaluation of Antioxidants in Alzheimer Disease, 7th International Turkic World Conference on Chemical Sciences and Technologies (ITWCCST2026), (26.06.2026), Sakarya, Türkiye
  4. AYIK Y., GÜNEŞ D. B., ARSLAN S., YILDIRIM Ş., TURAL E. N., ARICI A., ÖZEL C., SAKARYA D., ÖZARSLAN A. C., YÜCEL S., THE EFFECTS OF H2O:TEOS RATIO ON THE COMPOSITION AND MORPHOLOGY OF BIOACTIVE GLASSES SYNTHESIZED BY THE STÖBER METHOD, 12th International Conference on New Trends in Chemistry (ICNTC2026), (10.04.2026), Barcelona/SPAIN
  5. ÖZEL C., ERCAN S., AYIK Y., YILDIRIM Ş., ARSLAN S., GÜNEŞ D. B., TURAL E. N., SAKARYA D., ÖZARSLAN A. C., HASKÖYLÜ M. E., YÜCEL S., Effects of Strontium and Selenium-Doped Bioactive Glasses on Soft Tissue Applications: An In Vitro Evaluation, 12th International Conference on New Trends in Chemistry (ICNTC2026), (10.04.2026), Barcelona
  6. YÜCEL S., AYIK Y., YILDIRIM Ş., ARSLAN S., GÜNEŞ D. B., TURAL E. N., ÖZEL C., SAKARYA D., ÖZARSLAN A. C., A NEW APPROACH TO THE SYNTHESIS OF A SELENIUM-DOPED BIOACTIVE GLASS SYSTEM: IMPLICATIONS FOR BIOACTIVITY AND DEGRADATION BEHAVIOR, 12th International Conference on New Trends in Chemistry (ICNTC2026), (10.04.2026), Barcelona
  7. Ayık Y., Tural E. N., Güneş D. B., Arslan S., Yıldırım Ş., Ercan S., Sakarya D., Özel C., Erginer M., Özarslan A. C., Yücel S., An Insight to Morphological, Structural and In vitro Cytotoxicity Properties of Monodisperse, Strontium Doped Bioactive Glass with SiO₂–CaO–P₂O₅, SrO Composition, 2nd International Conference “Modern Problems of Theoretical and Experimental Chemistry, (18.12.2025), Bakü, Azerbaycan
  8. Ayık Y., Özdemir M., Gündoğdu M., Emeç M., Atalay V. E., An evaluation of antioxidants in Alzheimer disease, International Conference on Current Problems in Engineering and Applied Sciences (ICCPEAS 2025), (27.11.2025), Online
  9. Ayık Y., Alizadeh A., Özel C., Özarslan A. C., Yücel S., Evaluation of Morphological and Structural Properties of Silicate-Based Bioactive Glass Nanoparticles as a Function of Production Conditions and Sodium Content, 12th International Conference on Materials Science and Nanotechnology For Next Generation (MSNG-2025), (10.09.2025), Sivas-Türkiye
  10. Keleş G., Temel-Soylu T. M., Güner K. Ö., Ayık Y., Tekerek B. S., Kuçak M., Kara İ. T., Özel C., Özarslan A. C., Yücel S., Production of Ion-Doped Novel Bioactive Glass-Containing Polymeric Membranes and Evaluation of Their Bioactivity Properties, 12th International Conference on Materials Science and Nanotechnology For Next Generation (MSNG-2025), (10.09.2025), Sivas-Türkiye
  11. Güner K. Ö., Tekerek B. S., Özarslan A. C., Elalmış Y., Özel C., Kara İ. T., Kuçak M., Ayık Y., Yücel S., Synthesis, Characterization, and in vitro Biological Evaluation of Boron, Magnesium, and Vanadium Doped Bioactive Glasses for Tissue Engineering Applications, 12th International Conference on Materials Science and Nanotechnology For Next Generation (MSNG-2025), (10.09.2025), Sivas-Türkiye
  12. Yusufoğlu B., Ayık Y., Atalay V. E., Investigation of inhibition capacities of several anthocyanins on AGEs-RAGE complex by molecular docking, 49th FEBS Congress, (05.07.2025), İstanbul-Türkiye
  13. Mutlu B. S., Ayık Y., Atalay V. E., Development of QSAR Models to Discover Potential Drug Molecules for Scabies Disease, 5th International Symposium of Scientific Research and Innovative Studies, (19.03.2025), Balıkesir-Türkiye (Online)
  14. Çakır G., Ayık Y., Atalay V. E., IN SILICO IDENTIFICATION OF CANDIDATE PHYTOCHEMICALS FOR THE TREATMENT OF RECURRENT APHTHOUS STOMATITIS, 20th International Istanbul Scientific Research Congress on Life, Engineering, Architecture, and Mathematical Sciences, (21.02.2025), İstanbul-Türkiye (Online)
  15. Mutlu B. S., Ayık Y., Atalay V. E., DETERMINATION OF SOME TURKEY’S ENDEMIC PLANT ACTIVE COMPONENTS FOR TREATMENT OF SCABIES DISEASE BY MOLECULAR DOCKING, 20th International Istanbul Scientific Research Congress on Life, Engineering, Architecture, and Mathematical Sciences, (21.02.2025), İstanbul-Türkiye (Online)
  16. GÜNER K. Ö., AYIK Y., ÖZARSLAN A. C., ÖZEL C., KUÇAK M., TEKEREK B. S., YÜCEL S., Evaluation of Boron and Magnesium Co-doped SiO2–CaO–Na2O–P2O5, B2O3-MgO Novel Bioactive Glass Composition, International Conference on Advanced Materials for Biomedical and Environmental Challenges, (23.12.2024), Bakü-Azerbaycan
  17. Özdemir M., Gündoğdu M., Ayık Y., Atalay V. E., IDENTIFICATION OF ALTERNATIVE COMPOUNDS OF PLANT ORIGIN FOR WOUND, SCAR AND BURN TREATMENTS IN SILICO, 19th International Scientific Research Congress, (17.03.2024), Online
  18. Gündoğdu M., Özdemir M., Ayık Y., Atalay V. E., Computational Identification of New Candidate Actives of Plant Origin for Natural/Anti‐Photo Skin Aging, 4th International Symposium of Scientific Research and Innovative Studies, (13.03.2024), Online
  19. Atalay V. E., Ayık Y., Ocak H., Antioxidant Activity Analyses of Humic Acid And Fulvic Acid, International Conference on Innovative Engineering Applications, (20.09.2018), Sivas-Türkiye
  20. Atalay V. E., Ayık Y., Antioxidant Activity Analyses of Some Pyridazine Derivatives, International Conference on Physical Chemistry and Functional Materials, (19.06.2018), Elazığ-Türkiye

7.4. International books or chapters

  1. YÜCEL P. D. S., ATALAY A. P. D. V. E., AYIK R. A. Y., ANTIOXIDANTS, (2022), ISBN: 978-625-8377-34-7.
  2. YÜCEL P. D. S., ATALAY A. P. D. V. E., AYIK R. A. Y., COMPUTATIONAL CHEMISTRY FOR ANTIOXIDANTS, (2022), ISBN: ISBN: 978-625-8377-34-7.

7.5. Papers published in national peer-reviewed journals

  1. ATALAY V. E., AYIK Y., Yeni CDK2 İnhibitörlerinin Keşfedilmesi İçin Bazı Piridazin Türevi Bileşiklerin SAR Analizi ve Kenetlenme Çalışması, Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, (2022), 26(2), 268-274, .
  2. ATALAY V. E., AYIK Y., SAR Analysis and Molecular Modeling Study of Some Pyridazine Derivatives for Discovery of New CDK2 Inhibitors, Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, (2022), 26(2), 268-274, .

7.6. Assertions presented in national scientific congresses and published in the proceedings

  1. Ayık Y., Yücel S., Atalay V. E., Bitkisel Kaynaklı Çeşitli Bileşiklerin Antioksidan Aktivitelerinin HOMO-LUMO Enerji Haritaları Doğrultusunda Değerlendirilmesi, 31. Ulusal Kimya Kongresi, (10.09.2019), İstanbul-Türkiye
  2. Atalay V. E., Ayık Y., Yeni CDK2 İnhibitörlerinin Keşfedilmesi İçin Bazı Piridazin Türevi Bileşiklerin SAR Analizi ve Kenetlenme Çalışması, III. Yaşam Bilimleri Kongresi, (23.02.2018), Kayseri-Türkiye

7.7. National books or chapters

Books published by national publishers

Book chapters published by national publishers

8. Projects

  1. ÖZEL A. G. D. C., AYIK Y., YÜCEL P. D. S., KUÇAK A. G. D. M., TÜBİTAK, Sünger Kopyalama Yöntemi İle Tellür Ve Stronsiyum Katkılı Silika Biyoaktif Cam İskelesinin Karanfil Yağı Ile Geliştirilmesi Ve Karakterizasyonu, (Researcher), (Expire date :06.07.2027),
  2. ÖZEL A. G. D. C., AYIK Y., Yücel P. D. S., Tekerek D. Ö. Ü. B. S., Sinirlioğlu D. Ö. Ü. Z. A., Glasmacher P. P. h. D. B., Diğer Ulusal Kamu Kuruluşları , Süngerimsi Kemik Doku İçin Antibakteriyel ve Osteojenik Özelliklerinin Artırılmasına Yönelik 3B Biyobasım Yoluyla Ag, Se ve Sr Katkılı Biyoaktif Cam/PCL Kompozit Doku İskelelerinin Geliştirilmesi, (Researcher), (Expire date :15.06.2028),
  3. Yücel P. D. S., AYIK Y., Şahin D. D. Y. M., Hasköylü D. Ö. Ü. M. E., Kırgız D. Ö. Ü. Ö., Akçakavak D. Ö. Ü. G., ÖZARSLAN D. Ö. Ü. A. C., Sakarya Ö. G. D., Özel A. G. C., Özer D. S., TÜSEB, Yağ Greftlerinin Yaşayabilirliğini Artıran, Doku Kaybı ve Hasarının Giderilmesinde Kullanılabilecek Ce, Zn, Te Katkılı Biyoaktif Cam İçerikli Enjekte Edilebilir Dolguların Üretimi, Karakterizasyonu, In vitro ve In vivo Çalışmaların Değerlendirilmesi, (Researcher), (Expire date :25.07.2027),
  4. YÜCEL P. D. S., AYIK Y., Özmen P. D. M. M., ÖZARSLAN D. Ö. Ü. A. C., Arş. Gör. Dr. Mine Kuçak., ÖZEL A. G. C., SAKARYA Ö. G. D., Diğer Ulusal Kamu Kuruluşları , Yumuşak doku tümörlerinin çıkarılması sonucu oluşan boşlukların doldurulması amacıyla kullanılmak üzere biyoaktif cam katkılı kolajen artırıcı ve biyoaktivite özellikleri artırılmış enjekte edilebilir kompozit dolgu malzemesi üretimi ve karakterizasyonu, (Researcher), (Expire date :05.05.2027),
  5. Atalay D. D. V. E., AYIK Y., Emeç D. Ö. Ü. M., Gündoğdu M., Özdemir M., Diğer Ulusal Kamu Kuruluşları , Alzheimer Hastalığının tedavisinde aday antioksidan moleküllerin asetilkolinesteraz enziminin inhibasyonu için in siliko ve makine öğrenmesi teknikleri ile araştırılması, (Researcher), (Expire date :28.06.2026),
  6. YÜCEL P. D. S., AYIK Y., ÖZMEN P. D. M., DEMİRÖZ D. D. A., HASKÖYLÜ D. Ö. Ü. M. E., ÖZARSLAN D. Ö. Ü. A. C., SAKARYA Ö. G. D., (Bursiyer) A. G. Y. A., TÜBİTAK, Se, Sr ve B Olmak Üzere Üçlü İyon Katkılı Biyoaktif Cam ve Hyaluronik Asit İçerikli Enjekte Edilebilir Kompozit Dermal Dolgu Malzemesi Üretimi, Karakterizasyonu ve Deri Altı Dolgu Uygulamalarında Kullanılabilirliğinin ve Tedavi Edici Özelliklerinin Belirl, (Researcher), (Expire date :28.03.2027),
  7. (İNGİLİZCE) G. Ç. -. B., AYIK Y., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Tekrarlayan Aftöz Stomatit Tedavisinde Kullanılan Ticari Kimyasal İlaç Etkenlerine Alternatif Olabilecek Bitkisel Bileşiklerin In siliko Belirlenmesi, (Consultant), (Expire date :22.06.2025),
  8. (İNGİLİZCE) B. S. M. -. B., AYIK Y., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Türkiye’nin Bazı Endemik Bitki Türlerinde Yer Alan ve Uyuz Hastalığının Tedavisinde Kullanılabilecek Olan Aktif Bileşenlerin Moleküler Kenetlenme Yöntemi Aracılığıyla Belirlenmesi, (Consultant), (Expire date :22.06.2025),
  9. Gündoğdu M., AYIK Y., ATALAY V. E., - , TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Cildin Doğal/Foto Yaşlanması Karşıtı Bitkisel Kökenli Yeni Etken Bileşiklerin In Siliko Olarak Belirlenmesi, (Researcher), (Expire date :23.11.2024),
  10. Özdemir M., AYIK Y., - , ATALAY V. E., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, In Siliko Metotlarla Yara, Yara İzi ve Yanık Tedavileri için Alternatif Bitkisel Kökenli Bileşiklerin Belirlenmesi, (Researcher), (Expire date :23.11.2024),
  11. ATALAY V. E., AYIK Y., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Cildin Dogal/Foto Yaslanması Karsıtı Bitkisel Kökenli Yeni Etken Bilesiklerin In Siliko Olarak Belirlenmesi, (Researcher), (Expire date :17.11.2024),
  12. ATALAY V. E., AYIK Y., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, In Silico Metotlarla Yara, Yara Izi ve Yanık Tedavileri Için Alternatif Bitkisel Kökenli Bilesiklerin Belirlenmesi, (Researcher), (Expire date :17.11.2024),

9. Administrative Duties

  1. Komisyon Üyesi / Member of Commission - Kalite Komisyonu (Enstitü / Fakülte / MYO) (2025-Continues)
  2. Komisyon Üyesi / Member of Commission - Uluslararası Öğrenciler Akademik Komisyonu (2024-Continues)
  3. Raportör - Akreditasyon (Müdek, Fedek, Sabak vb) raportörlüğü (2023-Continues)
  4. Komisyon Başkanlığı / Head of Commission - Ders ve Sınav Programı Hazırlama Komisyon Başkanı (2020-Continues)
  5. Komisyon Üyesi / Member of Commission - Ders ve Sınav Programı Hazırlama Komisyonu (2020-Continues)
  6. Raportör - Fakülte ARGEYEP Raportörlüğü (2022-Continues)
  7. Raportör - Bilim ve Fikir Festivali (2021-Continues)
  8. Çalışma Grubu Üyelikleri / Research Group Membership - Biyomühendislik Çalışma Grubu (2020-Continues)
  9. Çalışma Grubu Üyelikleri / Research Group Membership - Biyokimyasal Hesaplamalar Grubu (2020-Continues)
  10. Raportör - Koordinatörlük / Komisyon Raportörlüğü (2020-Continues)

10. Scientific Memberships

  1. Elsevier Researcher Academy Üyeliği(2021)

11. Awards

12. Coourses recently given

Academic Year Semester Course name Hours Number of Students
Theoretical Application
2025-2026 Spring Genetic Engineering (Undergraduate) - Group 2 3 0 60
Bioengineering Laboratory I (Undergraduate) - Group 2 0 0 46
Bioengineering Laboratory II (Undergraduate) - Group 2 0 0 64
General Biology (Undergraduate) - Group 2 2 0 154
Climate Change Oriented Planning (Undergraduate) - Group 2 3 0 48
Fall Fundamentals of Chemistry (Undergraduate) - Group 1 3 0 23
General Microbiology (Undergraduate) - Group 1 2 0 31
Cell Biology (Undergraduate) - Group 1 3 0 24
2024-2025 Spring Bioengineering Laboratory II (Undergraduate) - Group 1 0 0 37
Genetic Engineering (Undergraduate) - Group 1 3 0 35
Bioengineering Laboratory I (Undergraduate) - Group 1 0 0 32
General Biology (Undergraduate) - Group 1 2 0 100
Fall Fundamentals of Chemistry (Undergraduate) - Group 1 3 0 32
Cell Biology (Undergraduate) - Group 1 3 0 44
General Microbiology (Undergraduate) - Group 1 2 0 38

Created: 14.10.2026