ÖZGEÇMİŞ

1. Adı Soyadı

 : NİGAR ÇARŞIBAŞI

2. Doğum Tarihi

 : 02.08.1979

3. Unvanı

 : Dr. Öğr. Üyesi

İletişim Bilgileri

: nigar.carsibasi@uskudar.edu.tr

4. Öğrenim Durumu

Derece Alan Üniversite Yıl
Lisans Kimya Mühendisliği Boğaziçi Üniversitesi 2001
Yüksek Lisans Kimya Mühendisliği Boğaziçi Üniversitesi 2003
Doktora Kimya Mühendisliği Boğaziçi Üniversitesi 2009

5. Akademik Unvanlar

Derece Alan Üniversite Yıl
Dr. Öğretim Üyesi Kimya Mühendisliği Üsküdar Üniversitesi 2019

6. Yönetilen Yüksek Lisans ve Doktora Tezleri

6.1. Yüksek Lisans Tezleri

  1. Alzheimer Hastalığının tedavisinde doğal kaynaklı ve FDA onaylı moleküllerin asetilkolinesteraz enziminin inhibasyonu için in siliko ve in vitro tekniklerle araştırılması, Münteha Girgin, 2023.
  2. Kanser tedavisinde Murine Double Minute 2 proteininin inhibasyonu için ligand-bazlı farmakofor modelleme tekniği ile yeni moleküllerin tasarımı, Elif Lokmacı, 2022.

7. Yayınlar

7.1. Uluslararası hakemli dergilerde yayınlanan makaleler (SCI & SSCI & Arts and Humanities)

  1. Canbolat F., Kantarci-Carsibasi N., Isik S., Shamshir S. R. M., Girgin M., Identification of the Candidate mGlu2 Allosteric Modulator THRX-195518 through In Silico Method and Evaluation of Its Neuroprotective Potential against Glutamate-Induced Neurotoxicity in SH-SY5Y Cell Line, Current Issues in Molecular Biology, (2024), (), , .
  2. Girgin M., Kantarci-Carsibasi N., Queuine as a potential multi-target drug for alzheimer’s disease: insights from protein dynamics, Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, (2023), (), 1-22, .
  3. Girgin M., Isik S., Kantarci-Carsibasi N., Proposing novel natural compounds against Alzheimer’s disease targeting acetylcholinesterase, PLOS ONE, (2023), 18(4), 1-23, .
  4. ÇARŞIBAŞI N. K., Elucidation of Conformational Dynamics of MDM2 and Alterations Induced Upon Inhibitor Binding Using Elastic Network Simulations and Molecular Docking, Journal of Computational Biophysics and Chemistry, (2021), 20(7), 751-764, .
  5. Uyar A., Kantarci-Carsibasi N., Haliloglu T., Doruker P., Features of large hing-bending conformational transitions. Prediction of closed structure from open state, Biophysical Journal, (2014), 106(12), 2656-2666, https://doi.org/10.1016/j.bpj.2014.05.017.
  6. Kantarci-Carsibasi N., Haliloglu T., Doruker P., Conformational transition pathways explored by monte carlo simulation integrated with collective modes, Biophysical Journal, (2008), 95(12), 5862-5873, https://doi.org/10.1529/biophysj.107.128447.
  7. Kantarci N., Doruker P., Haliloglu T., Cooperative fluctuations point to the dimerization interface of P53 core domain, Biophysical Journal, (2006), 91(2), 421-432, https://doi.org/10.1529/biophysj.106.077800.
  8. Kantarci N., Ulgen K. O., Borak F., A Study on Hydrodynamics and Heat Transfer in a Bubble Column Reactor with Yeast and Bacterial Cell Suspensions, The Canadian Journal of Chemical Engineering, (2005), 83(4), 764-773, .
  9. Kantarci N., Borak F., Ulgen K. O., Bubble Column Reactors, Process Biochemistry, (2005), 40(7), 2263-2283, https://doi.org/10.1016/j.procbio.2004.10.004.
  10. Kantarci N., Tamerler C., Sarikaya M., Haliloglu T., Doruker P., Molecular Dynamics Simulations on constraint metal binding peptides, Polymer, (2005), 46(12), 4307-4313, https://doi.org/10.1016/j.polymer.2005.03.016.

7.3. Uluslararası bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitabında (Proceeding) basılan bildiriler

  1. Çarşıbaşı N., , 7th International Conference on Innovative Studies of Contemporary Sciences, (21.04.2023), Tokyo-Japan
  2. Girgin M., Işık S., Kantarci-Carsibasi N., , 11th International Drug Chemistry Congress, (09.03.2023), Antalya-Türkiye
  3. , , The Sixth International Symposium on Pharmaceutical and Biomedical Sciences (ISPBS-6), (26.05.2022), Gaziantep-Türkiye
  4. Çarşıbaşı N., , 2. Computer-Aided Drug Design Symposium and Workshop-Linking Design, Biology, Chemistry and Medicine, (11.05.2022), İstanbul-Türkiye
  5. Çarşıbaşı N., , 4th International Conference on Biological and Chemical Sciences, (24.11.2021), Ankara-Türkiye
  6. , , 23th International Conference on Drug Discovery, Design, Development and Optimization, (22.03.2021), Dubai-Birleşik Arap Emirlikleri

7.4. Yazılan Uluslararası kitaplar veya kitaplarda bölümler

  1. Çarşıbaşı N. K., Natural Source Drug Molecules Targeting Alzheimer’s Disease, (2023), ISBN: 978-625-6971-13-4.
  2. ÇARŞIBAŞI N., COMPUTER AIDED DRUG DESIGN: LINKING SIMULATION WITH MEDICINE, (2022), ISBN: 978-625-8217-81-0.

7.5. Ulusal hakemli dergilerde yayınlanan makaleler

7.6. Ulusal bilimsel toplantılarda sunulan bildiri kitabında basılan bildiriler

  1. , , 8th multidisciplinary cancer research congress, (16.01.2021), İstanbul-Türkiye

7.7. Diğer Yayınlar

Ulusal yayınevi tarafından basılmış kitap

Ulusal yayınevi tarafından basılmış kitap bölümü

8. Projeler

  1. OYMAK M. M., ÇARŞIBAŞI N., Paksoy A. İ., ARSLAN M. B., ŞİMŞEK Ö., BAP projesi, Kimya Mühendisliğinde Temel Proses Ekipmanlarının Kurulumu ve Uygulamaları, (Araştırmacı), (Tamamlanma Tarihi :20.01.2024),
  2. OYMAK M. M., ÇARŞIBAŞI N., ARSLAN M. B., ŞİMŞEK Ö., Paksoy A. İ., BAP projesi, Kimya Mühendisliğinde Temel Proses Ekipmanlarının Kurulumu ve Uygulamaları, (Araştırmacı), (Tamamlanma Tarihi :20.01.2024),
  3. OYMAK M. M., ÇARŞIBAŞI N., Paksoy A. İ., ARSLAN M. B., ŞİMŞEK Ö., BAP projesi, Kimya Mühendisliğinde Temel Proses Ekipmanlarının Kurulumu ve Uygulamaları, (Araştırmacı), (Tamamlanma Tarihi :20.01.2024),
  4. YAYINTAŞ Ö., IŞIK S., ÇARŞIBAŞI N., Diğer ulusal resmi kamu kuruluşlar, yükseköğretim kurumları ve özel kuruluşlar tarafından desteklenen Ar-Ge projeleri, Yeşil Kimya ile Sentezlenen Altın ve Seryum Oksit Nanopartiküllerin Nöroprotektif Etkisinin İn Vivo ve İn Vitro Şartlarda Değerlendirilmesi, (Araştırmacı), (Tamamlanma Tarihi :01.11.2023),
  5. Yayıntaş P. D. Ö., ÇARŞIBAŞI N., IŞIK S., Canbolat D. Ö. Ü. F., Büyük D. Ö. Ü. B., Eroğlu D. D. H. A., Demir P. D. N., Diğer ulusal resmi kamu kuruluşlar, yükseköğretim kurumları ve özel kuruluşlar tarafından desteklenen Ar-Ge projeleri, Yeşil Kimya ile Sentezlenen Altın ve Seryum Oksit Nanopartiküllerin Nöroprotektif Etkisinin İn Vivo ve İn Vitro Şartlarda Değerlendirilmesi, (Araştırmacı), (Tamamlanma Tarihi :20.09.2024),
  6. ÇARŞIBAŞI N., IŞIK S., BAP projesi, Alzheimer Hastalığının tedavisinde doğal kaynaklı ve FDA onaylı moleküllerin asetilkolinesteraz enziminin inhibasyonu için in siliko ve in vitro tekniklerle araştırılması, (Yürütücü), (Tamamlanma Tarihi :01.12.2023),
  7. ÇARŞIBAŞI N., IŞIK S., BAP projesi, Alzheimer Hastalığının tedavisinde doğal kaynaklı ve FDA onaylı moleküllerin asetilkolinesteraz enziminin inhibasyonu için in siliko ve in vitro tekniklerle araştırılması, (Yürütücü), (Tamamlanma Tarihi :01.12.2023),
  8. Canbolat F., ÇARŞIBAŞI N., IŞIK S., BAP projesi, İn Silico Analiz ile Aday mglu2 Pozitif Allosterik Modülatörün Bulunması ve Nöroprotektif Etkisinin In Vitro Ortamda Değerlendirilmesi, (Araştırmacı), (Tamamlanma Tarihi :01.04.2023),
  9. Canbolat D. Ö. Ü. F., ÇARŞIBAŞI N., IŞIK S., BAP projesi, In Silico Analiz ile Aday mglu2 Positif Allosterik Modülatörün Bulunması ve Nöroprotektif Etkisinin In Vitro Ortamda Değerlendirilmesi, (Araştırmacı), (Tamamlanma Tarihi :02.05.2023),

9. İdari Görevler

  1. Bölüm Başkan Yardımcısı / Deputy Head of Department - Kimya-Biyoloji Mühendisliği (İngilizce) Bölüm Başkan Yardımcısı (2021-Devam Ediyor)
  2. Öğrenci Danışmanlığı / Student Adviser - 81-90 Öğrenci Danışmanlığı (2023-Devam Ediyor)
  3. Komisyon Üyesi / Member of Commission - Kalite Komisyonu (Enstitü / Fakülte / MYO) (2022-Devam Ediyor)
  4. Koordinatör / Coordinator - Erasmus Bölüm Koordinatörlüğü (2022-2023)
  5. Komisyon Üyesi / Member of Commission - Eğitim Komisyonu (Enstitü / Fakülte / MYO) (2019-Devam Ediyor)
  6. Öğrenci Kulübü Danışmanlığı / Head of Student Club - Kimya-Biyoloji Mühendisliği Kulübü (2022-Devam Ediyor)
  7. Çalışma Grubu Üyelikleri / Research Group Membership - Nörogenetik Çalışma Grubu (2022-Devam Ediyor)

10.Bilimsel Kuruluşlara Üyelikleri

11.Ödüller

12. Son iki yılda verdiği lisans ve lisansüstü düzeyindeki dersler

Akademik Yıl Dönem Dersin Adı Haftalık Saati Öğrenci Sayısı
Teorik Uygulama
2023-2024 Bahar Aktif yarıyıl dersleri, ilgili yarıyıl sonu itibariyle tabloya eklenmektedir.
Güz İlgili yarıyılda verilen ders bulunmamaktadır.
2022-2023 Bahar İlaç Tasarımı (Yüksek Lisans) - 1 Grup 3 0 21
Drug Design (Yüksek Lisans) - 1 Grup 3 0 20
General Chemistry II (Lisans) - 1 Grup 3 0 59
Organic Chemistry (Lisans) - 1 Grup 3 0 92
Graduation Thesis (Lisans) - 1 Grup 1 8 17
English II (Lisans) - 1 Grup 3 0 806
Güz Polimer İşleme Süreçleri, Modelleme ve Uygulamaları (Yüksek Lisans) - 1 Grup 3 0 3
Polymer Processing Principles, Applications and Modeling (Yüksek Lisans) - 1 Grup 3 0 3
Stoichiometry (Lisans) - 1 Grup 3 0 67
General Chemistry I (Lisans) - 2 Grup 3 0 131
Mass and Energy Balances (Lisans) - 1 Grup 3 2 62
Graduation Project (Lisans) - 1 Grup 2 2 12

Oluşturulma Tarihi: 18.04.2024