ACADEMIC BACKGROUND

1. Name Surname

 : Cihan TAŞTAN

2. Date of Birth

 :

3. Title

 : Dr. Öğr. Üyesi

Contact Information

: cihan.tastan@uskudar.edu.tr

4. Educational Background

Degree Department University Year
Undergraduate Moleküler Biyoloji ve Genetik ODTÜ 2011
Graduate
Doctorate Mikrobiyoloji-İmmunoloji New York Üniversitesi 2017

5. Academic Titles

Degree Department University Year
Lecturer Moleküler Biyoloji ve Genetik Üsküdar Üniversitesi 2020

6. Managed Master's and Doctoral Theses

6.1. Master's Theses

  1. KATI TÜMÖRLERDE YÜKSEK ANTİTÜMÖR ETKİNLİĞİ GÖSTERİLMİŞ MONOKLONAL ANTİKORLARLA YENİ NESİL KİMERİK ANTİJEN RESEPTÖR TASARLANMASINDA BİYOİNFORMATİKSEL YAKLAŞIMIN ARAŞTIRILMASI, Dilara ŞAHAN KHANKISHIYEV, 2022.

7. Publications

7.1. Articles published in internationally refereed journals (SCI & SSCI & Arts and Humanities)

  1. Turan R. D., Tastan C., Kancagi D. D., Yurtsever B., Karakus G. S., Ozer S., Abanuz S., Cakirsoy D., Tumentemur G., Demir S., Seyis U., Kuzay R., Elek M., Kocaoglu M. E., Ertop G., Arbak S., Elmas M. A., Hemsinlioglu C., Ng O. H., Akyoney S., Sahin I., Kayhan C. K., Tokat F., Akpinar G., Kasap M., Kocagoz A. S., Ozbek U., Telci D., Sahin F., Yalcin K., Ratip S., Ince U., Ovali E., Gamma-irradiated SARS-CoV-2 vaccine candidate, OZG-38.61.3, confers protection from SARS-CoV-2 challenge in human ACEII-transgenic mice, Scientific Reports, (2021), 11(), 15799, .
  2. Yenmis G., Sarac E. Y., Besli N., Soydas T., Tastan C., Kancagi D. D., Yilanci M., Senol K., Karagulle O. O., Ekmekci C. G., Ovali E., Tuncdemir M., Ulutin T., Sultuybek G. K., Anti-cancer effect of metformin on the metastasis and invasion of primary breast cancer cells through mediating NF-kB activity, Acta Histochemica, (2021), 123(4), 151709, .
  3. Karakus G. S., Tastan C., Kancagi D. D., Yurtsever B., Tumentemur G., Demir S., Turan R. D., Abanuz S., Cakirsoy D., Seyis U., Ozer S., Elibol O., Elek M., Ertop G., Arbak S., Elmas M. A., Hemsinlioglu C., Kocagoz A. S., Ng O. H., Akyoney S., Sahin I., Ozbek U., Telci D., Sahin F., Yalcin K., Ratip S., Ovali E., Preclinical efficacy and safety analysis of gamma-irradiated inactivated SARS-CoV-2 vaccine candidates, Scientific Reports, (2021), 11(5804), 1-19, .
  4. Berber B., Aydin C., Kocabas F., Guney-Esken G., Yilancioglu K., Karadag-Alpaslan M., Caliseki M., Yuce M., Demir S., Tastan C., Gene editing and RNAi approaches for COVID-19 diagnostics and therapeutics., Gene Therapy, (2020), (), 0-10, .
  5. Berber B., Aydin C., Kocabas F., Guney-Esken G., Yilancioglu K., Karadag-Alpaslan M., Caliseki M., Yuce M., Demir S., Tastan C., Gene editing and RNAi approaches for COVID-19 diagnostics and therapeutics, Gene Therapy, (2020), (), 1-16, .
  6. Okur H., K. Yalcin, C. Tastan, S. Demir, B. Yurtsever, Karakus G., Kancagi D., S. Abanuz, U. Seyis, R. Zengin, C. Hemsinlioglu, M. Kara, Yildiz M., E. Deliceo, N. Birgen, Pelit N., C. Cuhadaroglu, Kocagoz A., E. Ovali, Preliminary report of in vitro and in vivo effectiveness of dornase alfa on SARS-CoV-2 infection, New Microbes and New Infections, (2020), 37(), 100756, .
  7. Taştan C., Kançağı D. D., Turan R. D., Yurtsever B., Çakırsoy D., Abanuz S., Yılancı M., Seyis U., Özer S., Mert S., Kayhan C. K., Tokat F., Elmas M. A., Birdoğan S., Arbak S., Yalçın K., Sezgin A., Kızılkılıç E., Hemşinlioğlu C., İnce Ü., Ratip S., Ovalı E., Preclinical Assessment of Efficacy and Safety Analysis of CAR-T Cells (ISIKOK-19) Targeting CD19-Expressing B-Cells for the First Turkish Academic Clinical Trial with Relapsed/Refractory ALL and NHL Patients, Turkish Journal of Hematology, (2020), 37(4), 234-247, .
  8. TAŞTAN C., YURTSEVER B., KARAKUŞ G. S., KANÇAĞI D. D., DEMİR S., ABANUZ S., SEYİS U., YILDIRIM M., KUZAY R., ELİBOL Ö., ARBAK S., ELMAS M. A., BİRDOĞAN S., SEZERMAN O. U., KOCAGÖZ A. S., YALÇIN K., OVALI E., SARS-CoV-2 isolation and propagation from Turkish COVID-19 patients, Turkish Journal of Biology, (2020), 44(3), 192-202, .
  9. Tastan C., Karhan E., Zhou W., Fleming E., Voigt A. Y., Yao X., Wang L., Horne M., Placek L., Kozhaya L., Oh J., Unutmaz D., Tuning of human MAIT cell activation by commensal bacteria species and MR1-dependent T-cell presentation, Mucosal Immunology, (2018), 11(6), 1591-1605, .
  10. Chen X., Kozhaya L., Tastan C., Placek L., Dogan M., Horne M., Abblett R., Karhan E., Vaeth M., Feske S., Unutmaz D., Functional Interrogation of Primary Human T Cells via CRISPR Genetic Editing, The Journal of Immunology, (2018), 201(5), 1586-1598, .
  11. Khaitan A., Kilberg M., Kravietz A., Ilmet T., Tastan C., Mwamzuka M., Marshed F., Liu M., Ahmed A., Borkowsky W., Unutmaz D., HIV-Infected Children Have Lower Frequencies of CD8+ Mucosal-Associated Invariant T (MAIT) Cells that Correlate with Innate, Th17 and Th22 Cell Subsets, PLOS ONE, (2016), 11(8), e0161786, .

7.2. Articles published in other internationally refereed journals

  1. Akyürek E., Uysal B., Gülden G., Taştan C., The Effect Of Molecular Genetic Mechanisms On Drug Addiction And Related New Generation CRISPR Gene Engineering Applications, Gene Editing, (2021), (), 50-60, .
  2. Akpinar G., Tastan C., The Overall Consequence of Antiviral Drugs Given to Pregnant Women with COVID-19, Journal of Bacteriology & Parasitology, (2021), 0(S10), 002, .
  3. Tastan C., Yasar S., Tanyolac M. B., Turgut K., Şireli U. T., Atak C., Haliloglu K., Benlioglu K., Taşkın K. M., Barlas N., Yildiz G., CRISPR-Of-Things: Applications and Challenges of the Most Popular Gene Editing Tool in the Fields of Health, Agriculture and Environment, International Journal of Innovative Approaches in Science Research, (2020), 4(4), 153-190, .
  4. Ates C. T. A., Ermertcan S., Antibiyotiklere Alternatif Terapi: CRISPR-Cas antimikrobiyalleri, Gene Editing, (2020), (01), 30-35, .

7.3. Assertions presented in international scientific congresses and published in the proceedings

  1. Tastan C., , SBMT 19th Annual Congress, (13.03.2022), California, US
  2. Abanuz S., Turan R. D., Taştan C., Çakırsoy D., Kançağı D. D., Baykal A. T., Ovalı E., , 3rd International Eurasian Conference on Science, Engineering and Technology (EurasianSciEnTech 2021), (15.12.2021), Ankara
  3. Taştan C., , XVII. Tıbbi Biyoloji ve Gene@k Kongresi, (31.10.2021), Online
  4. TASTAN C., , European/International online meeting for the COST iPLANTA action : The Contribution of RNAi to Sustainable and Resilient Food Systems & Health, (23.02.2021), Norveç

7.4. Published international books or chapters in a book

  1. Ağca M. A., Taştan C., Üstün K., Giden I. H., Adaptive Chromosome Diagnosis Based on Scaling Hierarchical Clusters., (2021), ISBN: 978-3-030-70296-0.
  2. Taştan C., Pandemik Virüs Salgınlarında CRISPR Gen Mühendisliği İle Tanı, Araştırma Ve Tedavi Yaklaşımları, (2020), ISBN: 978-625-7897-52-5.
  3. Taştan C., Kartal Y., Gülden G., Köse M. E., Nadir Hastalıkların Tedavisinde Gen Terapisi, (2019), ISBN: 978-605-7895-15-8.

7.5. Articles published in national refereed journals

7.6. Assertions presented in national scientific congresses and published in the proceedings

  1. Taştan C., , Çocuk Göğüs Hastalıkları 5. Kongresi, (04.12.2021), İstanbul
  2. Taştan C., , Eskişehir 2. Sağlık ve Bilişim Sempozyumu, (21.10.2021), Eskişehir
  3. Taştan C., , Yıldız Teknik Üniversitesi Medikal Teknolojiler Kulübü Medivation II Zirvesi, (28.03.2021), İstanbul
  4. TAŞTAN C., , IEEE GTU G.E.N.4, (27.03.2021), İSTANBUL
  5. TAŞTAN C., , HIT2021 Kongresi, (07.03.2021), İstanbul
  6. TASTAN C., , IEEE YTÜ EMBS BİOFORM VIII, (24.12.2020), İstanbul-Türkiye
  7. TASTAN C., , 8. Ulusal Biyomühendislik Öğrenci Kongresi, (15.11.2020), İstanbul-Türkiye

7.7. Other publications

Books published by national publisher

Book chapters published by national publisher

  1. Taştan C., Yapay Zeka ve Genetik Mühendisliği, (2019), ISBN: 9789754361674.

8. Projects

  1. TAŞTAN C., YILDIRIM S. Ü., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, cpn60 ve cpn10 Saperon Gen Kasetinin Gluconacetobacter xylinus?a Aktarımı Ile Rekombinant, Soguga Dayanıklı Gluconacetobacter xylinus Sus Olusturulması ve Sogukta Selüloz Stabilitesinin In Vitro Arastırılması, (Head), (Expire date :16.05.2023),
  2. TAŞTAN C., YILDIRIM S. Ü., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Gluconacetobacter xylinus Bakterisinde Selüloz Üretim Verimliligini Artırmak Için AcsA, AcsB, AcsC, AcsD genlerinde CRISPR cas9 Indel Mutasyonlarının Olusturulması ve Verimlilik Etkinliginin In-vitro Arastırılması, (Head), (Expire date :16.05.2023),
  3. TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Fibroblast Hücrelerde Epidermolizis Bülloza Hastalıgına Yönelik Xeno Nükleik Asit ASO Tedavi Stratejisi, (Head), (Expire date :16.05.2023),
  4. TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Ilaç alerjisine sahip hastalarda immün profilleme ve genetik analize dayalı soy agacı arastırması, (Head), (Expire date :16.05.2023),
  5. TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Ailevi Akdeniz Atesi hastalarından izole T hücrelerinde CRISPR- dCas9- Vp64 hedefli IL1RN gen aktivasyonu iliskili sitokin salınım profilinin in vitro ve ex vivo arastırılması, (Head), (Expire date :16.05.2023),
  6. TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Mezenkimal kök hücrelerin lentivirüs aracılı nörotrofik faktör genlerinin aktarılması ile koklear tüy hücresi benzeri hücrelere farklılastırılmasının in-vitro arastırılması, (Head), (Expire date :16.05.2023),
  7. TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Flavonifractor plautii Bakterisinin FpGalNAcDeAc ve FpGalNase Enzimlerinin Rekombinant Olarak E.coli?de Üretiminin Saglanması ve Insan A Kan Gurubunu Evrensel 0 Kan Grubuna Çevrilmesinin in vitro Arastırılması, (Head), (Expire date :16.05.2023),
  8. TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Transgenik Mezankimal Kök Hücre Uygulamalarında 3D Yazıcı ile Gelistirilecek Kapsülasyon Yöntemleri Etkinliginin In Vitro Arastırılması, (Head), (Expire date :16.05.2023),
  9. TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Yer Çekimsiz Ortam Kosulları Saglayan Akustik Havaya Yükseltme (Levitasyon) Cihazında Kanser Hücrelerinin Proliferasyonunun ve Sag kalımının Arastırılması (In vitro), (Head), (Expire date :16.05.2023),
  10. TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Azot Emilimini Arttırmaya Yönelik CRISPR Cas9 Sistemiyle Nitrata Duyarlı (HNS) Gen Ailesinin Üzerinde CRISPR Cas9 Hedefli Mutasyon Taraması Yapmak ve Biyoyakıt Verimliligine Olan Etkisinin In Vitro Arastırılması, (Head), (Expire date :16.05.2023),
  11. TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Chlamydomonas reinhardtii?de CRISPR-Cas9 Gen Düzenleme Yöntemi ile Fosfolipaz A2, CpFTSY ve ZEP Genlerinde Genetik Mutasyon Analizleri Olusturulması, Fotosentetik Aktivitesindeki ve Lipit Aktivitesindeki Etkinliginin in vitro Arastırılması, (Head), (Expire date :16.05.2023),
  12. TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Mezenkimal Kök Hücrelerde Epidermolizis Bülloza Hastalıgına Yönelik DNA ASO Tedavi Stratejisi, (Head), (Expire date :16.05.2023),
  13. Gelsin B., TAŞTAN C., KONUK M., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Cüce Cavendish'de Muz Çizgi Virüsüne karşı CRISPR/Cas9 uygulamaları ile muz bitkisinin etkinliğini ve direncini artırmaya yönelik araştırma, (Researcher), (Expire date :05.11.2022),
  14. Budaklar B., TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, İlaç İçeriklerinin Bozulmasının Pratik Takibi Üzerine DNA Mürekkebi Geliştirilmesi ve Ürünün Orijinalliğinin Tespiti İçin DNA Barkotlama Teknolojisinin Geliştirilmesi, (Consultant), (Expire date :05.11.2022),
  15. Babar H. A., TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Aksolotllarda kanser direnç geni olan p53 geninin lentivirüs aktarım metodu ile insan hücre hatlarında entegrasyonu ve anti-tümör etki çalışılması., (Consultant), (Expire date :05.11.2022),
  16. Tiryaki N. N., TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Kansere Özgün Değiştirilebilir Başlıklı Adaptör CAR-T Hücre Geliştirilmesi ve Anti Kanser Etkiniğinin Değerlendirilmesi, (Consultant), (Expire date :05.11.2022),
  17. Teymur T., TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, TCR Blokajı ile Evrensel, Satışa Hazır CAR-T Hücresi Üretimi ve Anti-Kanser Etkinliğinin Değerlendirilmesi, (Consultant), (Expire date :05.11.2022),
  18. Ay Y., TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Primer Glioblastoma Hücrelerinde HER2 ve GD2 Hedefli Tandem CAR-T Hücrelerinin Etkinliğinin Değerlendirilmesi, (Consultant), (Expire date :05.11.2022),
  19. TAŞTAN C., BAP projesi, CRISPR.bot: Robotik Otonom Sistemler ile Bakterilerde Genetik Mühendislik, (Head), (Expire date :06.02.2022),
  20. Baran B., TAŞTAN C., KONUK M., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Buğdayın (Triticum vulgare), buğday cüce virüsü (WDV)’ne karşı direncini artırmak için CRISPR tabanlı modifikasyonların uygulanması, (Researcher), (Expire date :02.01.2022),
  21. İnci C. C., TAŞTAN C., YILANCIOĞLU K., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, HIV HIZLI TANI KİTİ, (Researcher), (Expire date :01.10.2021),
  22. Araz H., TAŞTAN C., IŞIK S., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Antibiyotik Dirençli Mycobacterium Smegmatis Bakterisi için CRISPR Kullanarak Dirençsiz Hale Getirmek, (Researcher), (Expire date :01.11.2021),
  23. ÇAVRAR İ., TAŞTAN C., IŞIK S., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Antibiyotiğe Dirençli Escherichia Coli Bakterisini CRISPR ile Dirençsiz Hale Getirme, (Researcher), (Expire date :01.11.2021),
  24. Kılıç Ö., TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Milnesium tardigradum türünde bulunan hsp70 proteini ile Rekombinant Dondurma Solüsyonu, (Consultant), (Expire date :01.02.2022),
  25. TAŞTAN C., KANÇAĞI D. D., TURAN R. D., Ovalı E., ÇAKIRSOY D., KAYHAN C. K., Tokat F., İNCE Ü., YURTSEVER B., Diğer ulusal resmi kamu kuruluşlar, yükseköğretim kurumları ve özel kuruluşlar tarafından desteklenen Ar-Ge projeleri, Phytohemagglutinin/ aCD3&aCD28 Tabanlı İki Farklı CD19 Spesifik CAR (CD28/4-1BB) T Hücre Üretiminin Pre-Klinik In Vitro ve In Vivo Etkinliklerinin Karşılaştırılması, (Head), (Expire date :02.01.2023),
  26. IŞIK S., TAŞTAN C., BAP projesi, Üsküdar Üniversitesi, Hücresel Tedavi ve Kök Hücre Üretim, Uygulama ve Araştırma Merkezi (ÜSKÖKMER) Bünyesinde Kök Hücre ARGE Laboratuvarı ve TRGENMER (Transgenik Hücre Teknolojileri ve Epigenetik Uygulama ve Araştırma Merkezi) Bünyesinde Transgenik Hücre, (Researcher), (Expire date :20.10.2021),
  27. TAŞTAN C., TÜBİTAK, Universal, Kullanıma Hazır Multi-spesifik Carnk92 Hücre Üretimi Ve Pre-klinik Etkinlik Çalışması, Araştırmacı, (Tamamlanma Tarihi :01.01.2022),
  28. TAŞTAN C., TÜBİTAK, Ülkemizde ve Dünyada Halk Sağlığını En Fazla Tehdit Eden HIV, HPV ve Influenza Kaynaklı Enfeksiyonlara Karşı Tanı Kitleri, İlaç Formülasyonları ve Aşı Geliştirilmesi, Araştırmacı, (Tamamlanma Tarihi :28.03.2021),

9. Administrative Duties

  1. Merkez Müdürü / Head of Resarch Center - TRGENMER (2021-Continues)
  2. Çalışma Grubu Üyelikleri / Research Group Membership - Nörogörüntüleme Çalışma Grubu (2021-Continues)
  3. Çalışma Grubu Üyelikleri / Research Group Membership - NPNörogenetik Çalışma Grubu (2021-Continues)

10. Scientific Memberships

  1. The Society of Experimental Biology (SEBM)(2021)

11. Awards

  1. The Society of Experimental Biology (SEBM), The Experimental Biology and Medicine (EBM) Outstanding Reviewer Award, (2021)
  2. Doktorclub Awards, Türkiye Geneli Nadir Hastalıklar Genetik Tedavi Yarışması - HiDNA-RaDiChal ile Yılın Medikal Endüstri Ödülleri- Yılın Sosyal Sorumluluk Projesi ödülü, (2020)

12. The undergraduate and graduate courses given in the last 2 years

Academic Year Semester Course name Hours Number of Students
Theoretical Application
2020-2021 Spring Molecular Genetics (Undergraduate) - Group 1 3 0 90
Graduation Thesis (Undergraduate) - Group 1 0 0 2
Biyoinformatiğe Giriş (Undergraduate) - Group 1 2 2 73
Moleküler Genetik (Undergraduate) - Group 1 3 0 72
Mezuniyet Tezi (Undergraduate) - Group 1 0 0 7
Fall Immunology (Undergraduate) - Group 1 2 0 64
Graduation Project (Undergraduate) - Group 1 0 0 2
Proje (Undergraduate) - Group 1 0 0 7
2019-2020 Spring  
Fall  

Created: 07.07.2022