ACADEMIC BACKGROUND

1. Name Surname

 : Cihan TAŞTAN

2. Date of Birth

 :

3. Title

 : Dr. Öğr. Üyesi

Contact Information

: cihan.tastan@uskudar.edu.tr

4. Educational Background

Degree Department University Year
BSc Moleküler Biyoloji ve Genetik ODTÜ 2011
MSc
PhD Mikrobiyoloji-İmmunoloji New York Üniversitesi 2017

5. Academic Titles

Degree Department University Year
Assistant Professor Moleküler Biyoloji ve Genetik Üsküdar Üniversitesi 2020

6. Supervised Theses

6.1. Master's Theses

  1. CRISPR PRIME EDITING GEN DÜZENLEME YAKLAŞIMLARI KULLANILARAK SURVIVAL MOTOR NÖRON-2 (SMN2) GENİ ÜZERİNDEKİ NOKTA MUTASYONLARIN ONARIM ETKİNLİĞİNİN ARAŞTIRILMASI, Enes Bal, 2023.
  2. KATI TÜMÖRLERDE YÜKSEK ANTİTÜMÖR ETKİNLİĞİ GÖSTERİLMİŞ MONOKLONAL ANTİKORLARLA YENİ NESİL KİMERİK ANTİJEN RESEPTÖR TASARLANMASINDA BİYOİNFORMATİKSEL YAKLAŞIMIN ARAŞTIRILMASI, Dilara ŞAHAN KHANKISHIYEV, 2022.

6.2. Doctorate Theses

  1. METİSİLİNE DİRENÇLİ KLİNİK STAPHYLOCOCCUS AUREUS İZOLATLARINDA ANTİBİYOTİK DİRENCİNİN CRISPR/Cas9 TEMELLİ GENOM DÜZENLEMESİ İLE BASKILANMASI, Ayşegül Ateş, 2023.

7. Publications

7.1. Papers published in internationally refereed journals (Scopus Indexed)

  1. Ates A., Tastan C., Ermertcan S., CRISPR-Cas9-Mediated Targeting of Multidrug Resistance Genes in Methicillin-Resistant <i>Staphylococcus aureus</i>, The CRISPR Journal, (2024), (), , .
  2. Demir S., Tastan C., Ulu Z. O., Canbaz E. N., Unlen L., Sahin F., Comparison of strain specific pathogenicity of Herpes Simplex Virus Type 1 by high-throughput sequencing, Journal of Virological Methods, (2024), 329(), 114994, .
  3. Kose A. M., Kocadagli O., Taştan C., Aktan C., Ünaldı O. M., Güzenge E., Erdil H. E., Unveiling Off-Target Mutations in CRISPR Guide RNAs: Implications for Gene Region Specificity, The CRISPR Journal, (2024), 7(3), 168-178, .
  4. Sert B., Gulden G., Teymur T., Ay Y., Turan R. D., Unaldi O. M., Guzenge E., Erdil H. E., Isik S., Oz P., Bozkurt I., Ozer S., Yurdakul T., Kamali O., Ovali E., Tarhan N., Tastan C., Enhancing CAR-T cells: unleashing lasting impact potential with phytohemagglutinin activation in in vivo leukemia model, Cancer Gene Therapy, (2023), (), , .
  5. Eren S. A., Tastan C., Karadeniz K. B., Turan R. D., Cakirsoy D., Kancagi D. D., Yilmaz S. U., Oztatlici M., Oztatlici H., Ozer S., Tumentemur G., Baykal A. T., Ovali E., Lentiviral micro-dystrophin gene treatment into late-stage mdx mice for Duchene Muscular Dystrophy disease, Current Gene Therapy, (2023), (), 1-12, .
  6. Hemşinlioğlu C., Aslan E. S., Taştan C., Çakırsoy D., Turan R. D., Seyis U., Elek M., Karakuş G. S., Günaydın Ö. S., Abanuz S., Kançağı D. D., Yurtsever B., Yalçın9 K., Kasap M., Ovalı E., In Vitro FVIII Encoding Transgenic Mesenchymal Stem Cells Maintain A Successful Coagulation in FVIII- Deficient Plasma Mimicking Hemophilia A, Turkish Journal of Hematology, (2023), (), 24, .
  7. Gulden G., Sert B., Teymur T., Ay Y., Tiryaki N. N., Mishra A. K., Ovali E., Tarhan N., Tastan C., CAR-T Cells with Phytohemagglutinin (PHA) Provide Anti-Cancer Capacity with Better Proliferation, Rejuvenated Effector Memory, and Reduced Exhausted T Cell Frequencies., Vaccines, (2023), 11(2), 313, .
  8. Erdoğan E., Yalçın K., Hemşinlioğlu C., Sezgin A., Seyis U., Kancağı D. D., Taştan C., Yurtsever B., Turan R. D., Çakırsoy D., Abanuz S., Karakuş G. S., Elek M., Beköz H. S., Gemici A. İ., Sargın D., Arat M., Ferhanoğlu B., Pekgüç E., Örnek S., Büyüktaş D., Birgen N., Ratip S., Ovalı E., Preliminary Report of the Academic CAR-T (ISIKOK-19) Cell Clinical Trial in Turkey: Characterization of Product and Outcomes of Clinical Application, Turkish Journal of Hematology, (2022), (39), 206-210, .
  9. Turan R. D., Tastan C., Kancagi D. D., Yurtsever B., Karakus G. S., Ozer S., Abanuz S., Cakirsoy D., Tumentemur G., Demir S., Seyis U., Kuzay R., Elek M., Kocaoglu M. E., Ertop G., Arbak S., Elmas M. A., Hemsinlioglu C., Ng O. H., Akyoney S., Sahin I., Kayhan C. K., Tokat F., Akpinar G., Kasap M., Kocagoz A. S., Ozbek U., Telci D., Sahin F., Yalcin K., Ratip S., Ince U., Ovali E., Gamma-irradiated SARS-CoV-2 vaccine candidate, OZG-38.61.3, confers protection from SARS-CoV-2 challenge in human ACEII-transgenic mice, Scientific Reports, (2021), 11(), 15799, .
  10. Yenmis G., Sarac E. Y., Besli N., Soydas T., Tastan C., Kancagi D. D., Yilanci M., Senol K., Karagulle O. O., Ekmekci C. G., Ovali E., Tuncdemir M., Ulutin T., Sultuybek G. K., Anti-cancer effect of metformin on the metastasis and invasion of primary breast cancer cells through mediating NF-kB activity, Acta Histochemica, (2021), 123(4), 151709, .
  11. Karakus G. S., Tastan C., Kancagi D. D., Yurtsever B., Tumentemur G., Demir S., Turan R. D., Abanuz S., Cakirsoy D., Seyis U., Ozer S., Elibol O., Elek M., Ertop G., Arbak S., Elmas M. A., Hemsinlioglu C., Kocagoz A. S., Ng O. H., Akyoney S., Sahin I., Ozbek U., Telci D., Sahin F., Yalcin K., Ratip S., Ovali E., Preclinical efficacy and safety analysis of gamma-irradiated inactivated SARS-CoV-2 vaccine candidates, Scientific Reports, (2021), 11(5804), 1-19, .
  12. Berber B., Aydin C., Kocabas F., Guney-Esken G., Yilancioglu K., Karadag-Alpaslan M., Caliseki M., Yuce M., Demir S., Tastan C., Gene editing and RNAi approaches for COVID-19 diagnostics and therapeutics., Gene Therapy, (2020), (), 0-10, .
  13. Berber B., Aydin C., Kocabas F., Guney-Esken G., Yilancioglu K., Karadag-Alpaslan M., Caliseki M., Yuce M., Demir S., Tastan C., Gene editing and RNAi approaches for COVID-19 diagnostics and therapeutics, Gene Therapy, (2020), (), 1-16, .
  14. Okur H., K. Yalcin, C. Tastan, S. Demir, B. Yurtsever, Karakus G., Kancagi D., S. Abanuz, U. Seyis, R. Zengin, C. Hemsinlioglu, M. Kara, Yildiz M., E. Deliceo, N. Birgen, Pelit N., C. Cuhadaroglu, Kocagoz A., E. Ovali, Preliminary report of in vitro and in vivo effectiveness of dornase alfa on SARS-CoV-2 infection, New Microbes and New Infections, (2020), 37(), 100756, .
  15. Taştan C., Kançağı D. D., Turan R. D., Yurtsever B., Çakırsoy D., Abanuz S., Yılancı M., Seyis U., Özer S., Mert S., Kayhan C. K., Tokat F., Elmas M. A., Birdoğan S., Arbak S., Yalçın K., Sezgin A., Kızılkılıç E., Hemşinlioğlu C., İnce Ü., Ratip S., Ovalı E., Preclinical Assessment of Efficacy and Safety Analysis of CAR-T Cells (ISIKOK-19) Targeting CD19-Expressing B-Cells for the First Turkish Academic Clinical Trial with Relapsed/Refractory ALL and NHL Patients, Turkish Journal of Hematology, (2020), 37(4), 234-247, .
  16. TAŞTAN C., YURTSEVER B., KARAKUŞ G. S., KANÇAĞI D. D., DEMİR S., ABANUZ S., SEYİS U., YILDIRIM M., KUZAY R., ELİBOL Ö., ARBAK S., ELMAS M. A., BİRDOĞAN S., SEZERMAN O. U., KOCAGÖZ A. S., YALÇIN K., OVALI E., SARS-CoV-2 isolation and propagation from Turkish COVID-19 patients, Turkish Journal of Biology, (2020), 44(3), 192-202, .
  17. Tastan C., Karhan E., Zhou W., Fleming E., Voigt A. Y., Yao X., Wang L., Horne M., Placek L., Kozhaya L., Oh J., Unutmaz D., Tuning of human MAIT cell activation by commensal bacteria species and MR1-dependent T-cell presentation, Mucosal Immunology, (2018), 11(6), 1591-1605, .
  18. Chen X., Kozhaya L., Tastan C., Placek L., Dogan M., Horne M., Abblett R., Karhan E., Vaeth M., Feske S., Unutmaz D., Functional Interrogation of Primary Human T Cells via CRISPR Genetic Editing, The Journal of Immunology, (2018), 201(5), 1586-1598, .
  19. Khaitan A., Kilberg M., Kravietz A., Ilmet T., Tastan C., Mwamzuka M., Marshed F., Liu M., Ahmed A., Borkowsky W., Unutmaz D., HIV-Infected Children Have Lower Frequencies of CD8+ Mucosal-Associated Invariant T (MAIT) Cells that Correlate with Innate, Th17 and Th22 Cell Subsets, PLOS ONE, (2016), 11(8), e0161786, .

7.2. Papers published in other internationally peer-reviewed journals

  1. Araz H., Sensitization of The Antibiotic Resistant M. smegmatis Bacteria Using CRISPR/FnCpf1 Gene Editing, Gene Editing, (2023), (), , .
  2. Bakaçhan D., The Effect Of Beta-Lactam-Containing Drugs On The Development Of Drug Allergy, Gene Editing, (2023), (), , .
  3. Cavrar I., Making Antibiotic-Resistant E. coli Non-Resistant with CRISPR/Cas9 Gene Editing, Gene Editing, (2023), (), , .
  4. Türk M., Chaperonin Variants in The Genus Acetobacter impacts Resistance To The Heat-Shock Stress, Gene Editing, (2023), (), , .
  5. Khankishiyev D. S., Gulden G., Sert B., Tastan C., Current Challenges and Potential Strategies for Designing a New Generation of Chimeric Antigen Receptor-T cells with High Anti-tumor Activity in Solid Tumors, Current Tissue Microenvironment Reports, (2023), (), 1-16, .
  6. Akyürek E., Uysal B., Gülden G., Taştan C., The Effect Of Molecular Genetic Mechanisms On Drug Addiction And Related New Generation CRISPR Gene Engineering Applications, Gene Editing, (2021), (), 50-60, .
  7. Tastan C., Yasar S., Tanyolac M. B., Turgut K., Şireli U. T., Atak C., Haliloglu K., Benlioglu K., Taşkın K. M., Barlas N., Yildiz G., CRISPR-Of-Things: Applications and Challenges of the Most Popular Gene Editing Tool in the Fields of Health, Agriculture and Environment, International Journal of Innovative Approaches in Science Research, (2020), 4(4), 153-190, .
  8. Ates C. T. A., Ermertcan S., Antibiyotiklere Alternatif Terapi: CRISPR-Cas antimikrobiyalleri, Gene Editing, (2020), (01), 30-35, .

7.3. Assertions presented in international scientific congresses and published in the proceedings

  1. taştan c., CRISPR Gen Mühendisliği, BioTürkiye Uluslararası Biyoteknoloji Kongresi, (29.09.2023), İstanbul
  2. Taştan C., Bioinformatic Analysis of Genetic Profiles in Neurological Disorders, 2022 ECNS Conferences - EEG and Clinical Neuroscience Society, (28.10.2022), Halifax NS USA
  3. Taştan C., Investigation of CRISPR-Prime Editing Approach as a Potential Gene Therapy Method for Rare Diseases, I. International Advances in Molecular Biology Congress, (22.09.2022), Istanbul-Türkiye
  4. Tastan C., Cam B. E., Demir B. O., Sert M. B., Gulden M. G., Tekirdagli B. B., In-vitro Investigation of Proliferation, Differentiation and Survival Capacity of Mesenchymal Stem Cells, Cancer and Lymphocytes in an Acoustic Levitation Device Providing Micro Gravity, 44th COSPAR Scientific Assembly, (16.07.2022), Atina-Yunanistan
  5. Taştan C., Gene Editing in Neurons, MIDDLE EAST (ME) + Brain Initiative, (01.07.2022), Istanbul-Türkiye
  6. Yelgen G., Bal E., Odabas S. P., Erkek F. N., Gulden G., Sert B., Teymur T., Ay Y., Tiryaki N. N., Araz H., Cavrar I., Tastan C., Exon7 Targeted CRISPR-Prime Editing Approaches for SMN2 Gene Editing in Spinal Muscular Atrophy, 11th European Conference on Rare Diseases & Orphan Products, (27.06.2022), online
  7. Kilic O., Araz H., Baran B., Gelsin B., Budaklar B., Inci C. C., Cavrar I., Babar H. A., Tastan C., Rare Disease Challenge (RaDiChal): Global InterUniversities Rare Disease Genetic Therapy Competition, 11th European Conference on Rare Diseases & Orphan Products, (27.06.2022), online
  8. Tastan C., Gene editing in Autism Spectrum Disorder and its Promising Results in Near Future, SBMT 19th Annual Congress, (13.03.2022), California, US
  9. Abanuz S., Turan R. D., Taştan C., Çakırsoy D., Kançağı D. D., Baykal A. T., Ovalı E., "Geç dönem Duchenne Müsküler Distrofi (DMD) hastalığında gen transferinin uzun vadede distrofin ekspresyonuna etkisinin test edilmesi" (Paper ID:404), 3rd International Eurasian Conference on Science, Engineering and Technology (EurasianSciEnTech 2021), (15.12.2021), Ankara
  10. Taştan C., Tanı ve Tedavide CRISPR Gen Düzenleme Yaklaşımları, XVII. Tıbbi Biyoloji ve Gene@k Kongresi, (31.10.2021), Online
  11. TASTAN C., TRNAi applications for diagnostics and therapeutics, European/International online meeting for the COST iPLANTA action : The Contribution of RNAi to Sustainable and Resilient Food Systems & Health, (23.02.2021), Norveç

7.4. International books or chapters

  1. TAŞTAN C., GÜLDEN G., SERT B., CAR-T Cell Therapy in Cancer: Current Pros and Cons, (2024), ISBN: 978-625-395-317-1.
  2. Ağca M. A., Taştan C., Üstün K., Giden I. H., Adaptive Chromosome Diagnosis Based on Scaling Hierarchical Clusters., (2021), ISBN: 978-3-030-70296-0.
  3. Taştan C., Pandemik Virüs Salgınlarında CRISPR Gen Mühendisliği İle Tanı, Araştırma Ve Tedavi Yaklaşımları, (2020), ISBN: 978-625-7897-52-5.
  4. Taştan C., Kartal Y., Gülden G., Köse M. E., Nadir Hastalıkların Tedavisinde Gen Terapisi, (2019), ISBN: 978-605-7895-15-8.

7.5. Papers published in national peer-reviewed journals

7.6. Assertions presented in national scientific congresses and published in the proceedings

  1. taştan c., Next-Generation Molecular Approaches to Understand the Genetic Mechanism of Addiction, 6th Basic and Clinical Multimodal Imaging Conference, (06.09.2023), Istanbul
  2. Tastan C., CRISPR Gen Mühendisliği ve RaDiChal, İYTE 4. Ulusal Moleküler Biyoloji ve Genetik Öğrenci Kongresi, (06.05.2023), İzmir
  3. Tastan C., CRISPR Prime Editing and Base Editing Approaches, 3rd International & 5th National CRISPR Symposium, (30.04.2023), Iran
  4. Tastan C., CRISPR Yöntemini Kullanarak Genetik Tedaviler Geliştirmek, Yeditepe Üniversitesi 10. Ulusal Genetik ve Biyomühendislik Kongresi, (14.04.2023), İstanbul
  5. Taştan C., The Future of Transhumanism: Genetic Therapies, 6th INTERNATIONAL CONFERENCE ON ADVANCES IN NATURAL AND APPLIED SCIENCES, (11.10.2022), Ağrı
  6. Taştan C., Genetik Tedavi Yaklaşımları, 11. Ulusal Moleküler Biyoloji ve Biyoteknoloji Kongresi, (08.10.2022), Istanbul
  7. Taştan C., Nörolojik Bozukluklarda Gen Düzenleme, 1. Ulusal Tıp Öğrencileri Kongresi, (28.05.2022), Istanbul-Türkiye
  8. Taştan C., CRISPR gen düzenleme ve gen terapisi, SBÜBAK 1. ULUSAL ÖĞRENCİ KONGRESİ, (26.05.2022), İstanbul-Türkiye
  9. Taştan C., Güncel küresel sağlık alanına dair gelişmeler, Pharmainovatif Hit2022 Kongre, (21.05.2022), Online
  10. Taştan C., CRISPR: Spinal Muskular Atrofi, 6. Farmasötik Gelişim Günleri, (16.04.2022), online
  11. Taştan C., DNA CRISPR Teknolojisi, Çocuk Göğüs Hastalıkları 5. Kongresi, (04.12.2021), İstanbul
  12. Taştan C., Nadir Hastalıkların Tedavisinde Bilişim Teknolojilerinin Kullanımı, Eskişehir 2. Sağlık ve Bilişim Sempozyumu, (21.10.2021), Eskişehir
  13. Taştan C., HiDNA: DNA Tabanlı Gelecek, Yıldız Teknik Üniversitesi Medikal Teknolojiler Kulübü Medivation II Zirvesi, (28.03.2021), İstanbul
  14. TAŞTAN C., Gen Mühendisliği ve Biyoendüstri 2.0, IEEE GTU G.E.N.4, (27.03.2021), İSTANBUL
  15. TAŞTAN C., Crispr Gen Mühendisliği Ve Genetik Tedavi Uygulamaları, HIT2021 Kongresi, (07.03.2021), İstanbul
  16. TASTAN C., DNA Tabanlı Gelecek ve Biyoendüstri 2.0, IEEE YTÜ EMBS BİOFORM VIII, (24.12.2020), İstanbul-Türkiye
  17. TASTAN C., Nobel Ödüllü CRISPR Gen Mühendisliği ve Bodyhacking, 8. Ulusal Biyomühendislik Öğrenci Kongresi, (15.11.2020), İstanbul-Türkiye

7.7. Other publications

Books published by national publishers

Book chapters published by national publishers

  1. Kurt A., Akın H., Taştan C., Apoptoz ve Otofaji İlişkili Mekanizmalarda CRISPR-Cas Uygulamaları -Hastalıkta ve Sağlıkta Hücre Ölümü - Mekanizmaları ve Deneysel Araştırma Modelleri, (2022), ISBN: 978-605-73554-1-6.
  2. Taştan C., Yapay Zeka ve Genetik Mühendisliği, (2019), ISBN: 9789754361674.

8. Projects

  1. BOZGEYİK E., TAŞTAN C., Işık F., Öztuzcu S., Sucu S., Kahraman D., Eronat Ö., Saadat S., TÜBİTAK, SIRPa geni knock-out edilmiş kordon kanından türevli NK hücrelerinin primer küçük hücre dışı akciğer kanseri hücreleri üzerindeki sitotoksik etkisinin araştırılması, (Researcher), (Expire date :10.11.2025),
  2. TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Developing A Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP) kit for detection of FecB gene variants in sheep blood.” "Koyun kanında FecB gen varyantlarının saptanması için Döngü Aracılı Izotermal Amplifikasyon (LAMP) kitinin gelistirilmesi., (Head), (Expire date :09.11.2024),
  3. TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Otoimmün Hepatit (AIH)’te C4A Geni Delesyonuna Sahip Hastaların Hepatosit Hücrelerinde C4A Geni Protein Seviyesi Arttırılması, (Head), (Expire date :09.11.2024),
  4. TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Nöroblastom Hücre Hattı SH-SY5Y ve Insan Oligodendroglial Hücre Hattı (HOG) Co-Kültüründe Cuprizone-Indüklenmis In Vitro Multipl Skleroz (MS) Modelinin Olusturulması ve Lentiral MOG Transdüksiyonu Sonrası Remiyelinizasyonun Arastırılması, (Head), (Expire date :09.11.2024),
  5. TAŞTAN C., IŞIK S., Diğer Ulusal Kamu Kuruluşları , Glikojen Depo Hastalığı (GSD) Tip 1a Hastalığının Tedavisi İçin 3B Yazıcı ile Kapsüle Edilmiş G6PC Transgenik Mezenkimal Kök Hücre ve Hepatosit Hücrelerinin Etkinliğinin In Vitro ve Ex Vivo Araştırılması, (Head), (Expire date :01.12.2024),
  6. IŞIK S., TAŞTAN C., Şahin P. D. F., Sümer V. H. D. E., Elibol D. D. B., TÜBİTAK, Topoizomeraz IIbeta Aşırı İfade Eden İnsan Kordon Mezenkimal Kök Hücre Kaynaklı Eksozomların 5XFAD Transgenik Alzheimer Hastalığı Fare Modelinde Tedavi Etkinliğinin Araştırılması, (Researcher), (Expire date :01.05.2026),
  7. TAŞTAN C., , Üsküdar Üniversitesi ve Aster Tekstil Üniversite Sanayii İşbirliği Projesi, (Head), (Expire date :01.08.2025),
  8. TARHAN K. N., METİN B., TAŞTAN C., ULUCAN K., KONUK M., IŞIK S., Emmanouil P., Georgios A., Lesch O., Walter a. H., - , Diğer Uluslararası Kuruluşlar (World Bank, WHO, FAO, Yurt Dışı Üniversiteler vb.), Genotypical Analysis Project on personalized treatment for psychosis and for dependence on alcohol and other psychotropic substances., (Researcher), (Expire date :30.06.2025),
  9. TAŞTAN C., Tekirdağlı B., Demir Ö., Çam E., Erkek F., Sert B., Gülden G., TÜBİTAK, MESAJ BİLİM MİSYONU (MİKRO YER ÇEKİMİ İLİŞKİLİ BİLİM GRUBU), (Head), (Expire date :26.04.2024),
  10. IŞIK S., TAŞTAN C., Diğer Ulusal Kamu Kuruluşları , Nöral Farklılaştırılmış ve Amiloid β1-42 Peptitleriyle in vitro Alzheimer Hastalığı Modeli Oluşturulmuş SHSY5Y Hücrelerinde Kararlı DNA Topoisomerase IIb Aşırı İfadesinin Nöroprotektif Rolünün Araştırılması, (Researcher), (Expire date :01.04.2024),
  11. IŞIK S., TAŞTAN C., Diğer Ulusal Kamu Kuruluşları , Nöral Farklılaştırılmış ve Amiloid β1-42 Peptitleriyle in vitro Alzheimer Hastalığı Modeli Oluşturulmuş SHSY5Y Hücrelerinde Kararlı DNA Topoisomerase IIb Aşırı İfadesinin Nöroprotektif Rolünün Araştırılması, (Researcher), (Expire date :01.05.2024),
  12. Ekşi M., TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Ailevi Akdeniz Atesi Hastalıgı Iliskili Mutant MEFV Geninde CRISPRPrime Editing Yöntemi ile M680I c.2040G>C Mutasyonunun Düzenlenmesinin Ex-Vivo Arastırılması, (Head), (Expire date :20.03.2024),
  13. GÜZENGE E., TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Axolotl Canlılarında Deselerizasyon Sonucu Insan Nöron Hücrelelerinin Ko-Kültürü ve Repopülasyonu, (Head), (Expire date :16.11.2023),
  14. OLTAN S., TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Yüksek BCL-2 ve USP7 Gen Ifadesine Sahip Küçük Hücreli Olmayan Akciger Kanserlerinde Yeni Nesil XNA ve DNA Antisens Oligonükleotit (ASO) Yaklasımlarının Incelenmesi, (Head), (Expire date :16.11.2023),
  15. BULUT D., TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Ailevi Akdeniz Atesi Hastalarından Izole Periferik Kan Mononükleer Hücrelerde M694V c.2080A>G Mutasyonunun CRISPR-Prime Editing Yöntemi ile Gen Düzenlenmesinin In-vitro ve Ex-Vivo Arastırılması, (Head), (Expire date :16.11.2023),
  16. ÇAM E., TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Yer çekimsiz Ortam Kosulları Saglayan Akustik Havaya Yükseltme (Levitasyon) Cihazında Mezenkimal Kök Hücrelerinin Proliferasyonunun ve Diferansiyasyonun Arastırılması (In vitro), (Head), (Expire date :16.11.2023),
  17. ÖZTUZCU S., IŞIK S., TAŞTAN C., Kahraman D., Diğer Ulusal Kamu Kuruluşları , IL-21 gen ifadelesi arttırılmış NK-92 hücre hattı kaynaklı eksozomların NK hücre aktivasyonu ve tümör öldürme kapasitelerinin araştırılması., (Researcher), (Expire date :01.11.2023),
  18. Öztuzcu D. D. s., IŞIK S., TAŞTAN C., IŞIK P. A. F., Öğr.Gör. Demet TAŞDEMİR, Diğer Ulusal Kamu Kuruluşları , Doğal Öldürücü Hücre Aktivasyon Gen İfadeleri Arttırılmış Nk-92 Hücre Hattı Kaynaklı Eksozomların, Küçük Hücreli Olmayan Akciğer Karsinom Hastaları Primer Tümör Hücreleri Ve Primer Nk Hücreleri Üzerindeki Etkisinin Araştırılması, (Researcher), (Expire date :26.08.2025),
  19. TAŞTAN C., Ceylaner S., Odabaş S. P., Yelgen G., Bal E., TÜBİTAK, CRISPR Prime Editing Gen Düzenleme Teknolojisi Ile Survival Motor Protein 2 (SMN2) Geni Hedefli Tek Nokta Nükleotit Modifikasyon Etkinliginin, Stabilitesinin ve Hedef-Dısı Mutasyon (Off-Target) Kapasitesinin In Vitro ve Ex Vivo Arastırılması, (Head), (Expire date :01.10.2023),
  20. ÖZTUZCU S., TAŞTAN C., IŞIK S., KAHRAMAN D., Diğer Ulusal Kamu Kuruluşları , IL-21 gen ifadelesi arttırılmış NK-92 hücre hattı kaynaklı eksozomların NK hücre aktivasyonu ve tümör öldürme kapasitelerinin araştırılması., (Researcher), (Expire date :01.11.2023),
  21. TAŞTAN C., Ceylaner S., Ceylaner G., Odabaş S. P., Yelgen G., Babar H. A., İnci C. C., Kılıç Ö., Diğer Ulusal Kamu Kuruluşları , Spinal Musküler Atrofi (SMA) Hastalığında SMN2 Gen Düzenlemesine Yönelik Ekzon7/ İntron 7 Hedefli Yeni Nesil CRISPR-Prime Editing ve SMN1 Kodlayan Motor Nöron Hücre Spesifik Nöral Lentivirüs Yaklaşımlarının İn Vitro ve Ex Vivo Araştırılması, (Head), (Expire date :01.10.2024),
  22. TAŞTAN C., Babar H. A., İnci C. C., Kılıç Ö., BAP projesi, Spinal Musküler Atrofi (SMA) Hastalığında SMN2 Gen Katılımını Artırmaya Yönelik İntron 7 Hedefli Yeni Nesil Antisense Xeno Nükleik Asit Yaklaşımlarının İn Vitro ve Ex Vivo Araştırılması, (Head), (Expire date :02.06.2023),
  23. TAŞTAN C., Gülden G., Sert B., BAP projesi, Yer Çekimsiz (Mikrogravity)Ortam koşulları Sağlayan Akustik Levitasyon Cihazının Geliştirilmesi Ve Temel Biyolojik Deneyler İle İn vitro Etkinliğinin Araştırılması, (Head), (Expire date :02.06.2023),
  24. TAŞTAN C., YILDIRIM S. Ü., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, cpn60 ve cpn10 Saperon Gen Kasetinin Gluconacetobacter xylinus?a Aktarımı Ile Rekombinant, Soguga Dayanıklı Gluconacetobacter xylinus Sus Olusturulması ve Sogukta Selüloz Stabilitesinin In Vitro Arastırılması, (Head), (Expire date :16.05.2023),
  25. TAŞTAN C., YILDIRIM S. Ü., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Gluconacetobacter xylinus Bakterisinde Selüloz Üretim Verimliligini Artırmak Için AcsA, AcsB, AcsC, AcsD genlerinde CRISPR cas9 Indel Mutasyonlarının Olusturulması ve Verimlilik Etkinliginin In-vitro Arastırılması, (Head), (Expire date :16.05.2023),
  26. TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Fibroblast Hücrelerde Epidermolizis Bülloza Hastalıgına Yönelik Xeno Nükleik Asit ASO Tedavi Stratejisi, (Head), (Expire date :16.05.2023),
  27. TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Ilaç alerjisine sahip hastalarda immün profilleme ve genetik analize dayalı soy agacı arastırması, (Head), (Expire date :16.05.2023),
  28. TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Ailevi Akdeniz Atesi hastalarından izole T hücrelerinde CRISPR- dCas9- Vp64 hedefli IL1RN gen aktivasyonu iliskili sitokin salınım profilinin in vitro ve ex vivo arastırılması, (Head), (Expire date :16.05.2023),
  29. TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Mezenkimal kök hücrelerin lentivirüs aracılı nörotrofik faktör genlerinin aktarılması ile koklear tüy hücresi benzeri hücrelere farklılastırılmasının in-vitro arastırılması, (Head), (Expire date :16.05.2023),
  30. TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Flavonifractor plautii Bakterisinin FpGalNAcDeAc ve FpGalNase Enzimlerinin Rekombinant Olarak E.coli?de Üretiminin Saglanması ve Insan A Kan Gurubunu Evrensel 0 Kan Grubuna Çevrilmesinin in vitro Arastırılması, (Head), (Expire date :16.05.2023),
  31. TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Transgenik Mezankimal Kök Hücre Uygulamalarında 3D Yazıcı ile Gelistirilecek Kapsülasyon Yöntemleri Etkinliginin In Vitro Arastırılması, (Head), (Expire date :16.05.2023),
  32. TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Yer Çekimsiz Ortam Kosulları Saglayan Akustik Havaya Yükseltme (Levitasyon) Cihazında Kanser Hücrelerinin Proliferasyonunun ve Sag kalımının Arastırılması (In vitro), (Head), (Expire date :16.05.2023),
  33. TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Azot Emilimini Arttırmaya Yönelik CRISPR Cas9 Sistemiyle Nitrata Duyarlı (HNS) Gen Ailesinin Üzerinde CRISPR Cas9 Hedefli Mutasyon Taraması Yapmak ve Biyoyakıt Verimliligine Olan Etkisinin In Vitro Arastırılması, (Head), (Expire date :16.05.2023),
  34. TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Chlamydomonas reinhardtii?de CRISPR-Cas9 Gen Düzenleme Yöntemi ile Fosfolipaz A2, CpFTSY ve ZEP Genlerinde Genetik Mutasyon Analizleri Olusturulması, Fotosentetik Aktivitesindeki ve Lipit Aktivitesindeki Etkinliginin in vitro Arastırılması, (Head), (Expire date :16.05.2023),
  35. TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Mezenkimal Kök Hücrelerde Epidermolizis Bülloza Hastalıgına Yönelik DNA ASO Tedavi Stratejisi, (Head), (Expire date :16.05.2023),
  36. Gelsin B., TAŞTAN C., KONUK M., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Cüce Cavendish'de Muz Çizgi Virüsüne karşı CRISPR/Cas9 uygulamaları ile muz bitkisinin etkinliğini ve direncini artırmaya yönelik araştırma, (Researcher), (Expire date :05.11.2022),
  37. Budaklar B., TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, İlaç İçeriklerinin Bozulmasının Pratik Takibi Üzerine DNA Mürekkebi Geliştirilmesi ve Ürünün Orijinalliğinin Tespiti İçin DNA Barkotlama Teknolojisinin Geliştirilmesi, (Consultant), (Expire date :05.11.2022),
  38. Babar H. A., TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Aksolotllarda kanser direnç geni olan p53 geninin lentivirüs aktarım metodu ile insan hücre hatlarında entegrasyonu ve anti-tümör etki çalışılması., (Consultant), (Expire date :05.11.2022),
  39. Tiryaki N. N., TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Kansere Özgün Değiştirilebilir Başlıklı Adaptör CAR-T Hücre Geliştirilmesi ve Anti Kanser Etkiniğinin Değerlendirilmesi, (Consultant), (Expire date :05.11.2022),
  40. Teymur T., TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, TCR Blokajı ile Evrensel, Satışa Hazır CAR-T Hücresi Üretimi ve Anti-Kanser Etkinliğinin Değerlendirilmesi, (Consultant), (Expire date :05.11.2022),
  41. Ay Y., TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Primer Glioblastoma Hücrelerinde HER2 ve GD2 Hedefli Tandem CAR-T Hücrelerinin Etkinliğinin Değerlendirilmesi, (Consultant), (Expire date :05.11.2022),
  42. TAŞTAN C., BAP projesi, CRISPR.bot: Robotik Otonom Sistemler ile Bakterilerde Genetik Mühendislik, (Head), (Expire date :06.02.2022),
  43. Baran B., TAŞTAN C., KONUK M., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Buğdayın (Triticum vulgare), buğday cüce virüsü (WDV)’ne karşı direncini artırmak için CRISPR tabanlı modifikasyonların uygulanması, (Researcher), (Expire date :02.01.2022),
  44. İnci C. C., TAŞTAN C., YILANCIOĞLU K., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, HIV HIZLI TANI KİTİ, (Researcher), (Expire date :01.10.2021),
  45. Araz H., TAŞTAN C., IŞIK S., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Antibiyotik Dirençli Mycobacterium Smegmatis Bakterisi için CRISPR Kullanarak Dirençsiz Hale Getirmek, (Researcher), (Expire date :01.11.2021),
  46. ÇAVRAR İ., TAŞTAN C., IŞIK S., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Antibiyotiğe Dirençli Escherichia Coli Bakterisini CRISPR ile Dirençsiz Hale Getirme, (Researcher), (Expire date :01.11.2021),
  47. Kılıç Ö., TAŞTAN C., TÜBİTAK Öğrenci Projesi, Milnesium tardigradum türünde bulunan hsp70 proteini ile Rekombinant Dondurma Solüsyonu, (Consultant), (Expire date :01.02.2022),
  48. TAŞTAN C., KANÇAĞI D. D., TURAN R. D., Ovalı E., ÇAKIRSOY D., KAYHAN C. K., Tokat F., İNCE Ü., YURTSEVER B., Diğer Ulusal Kamu Kuruluşları , Phytohemagglutinin/ aCD3&aCD28 Tabanlı İki Farklı CD19 Spesifik CAR (CD28/4-1BB) T Hücre Üretiminin Pre-Klinik In Vitro ve In Vivo Etkinliklerinin Karşılaştırılması, (Head), (Expire date :02.01.2023),
  49. IŞIK S., TAŞTAN C., BAP projesi, Üsküdar Üniversitesi, Hücresel Tedavi ve Kök Hücre Üretim, Uygulama ve Araştırma Merkezi (ÜSKÖKMER) Bünyesinde Kök Hücre ARGE Laboratuvarı ve TRGENMER (Transgenik Hücre Teknolojileri ve Epigenetik Uygulama ve Araştırma Merkezi) Bünyesinde Transgenik Hücre, (Researcher), (Expire date :20.10.2021),
  50. TAŞTAN C., Bozgeyik E., Işık F., Öztuzcu S., Sucu S., Kahraman D., Eronat Ö., Saadat S., TÜBİTAK, SIRPa geni knock-out edilmiş kordon kanından türevli NK hücrelerinin primer küçük hücre dışı akciğer kanseri hücreleri üzerindeki sitotoksik etkisinin araştırılması, Araştırmacı, (Tamamlanma Tarihi :01.01.2026),
  51. TAŞTAN C., IŞIK A. F., ÖZTUZCU S., TAŞDEMİR D., IŞIK S., BAP projesi, DOĞAL ÖLDÜRÜCÜ HÜCRE AKTİVASYON GEN İFADELERİ ARTTIRILMIŞ NK-92HÜCRE HATTI KAYNAKLI EKSOZOMLARIN, KÜÇÜK HÜCRELİ OLMAYAN AKCİĞERKARSİNOM HASTALARI PRİMER TÜMÖR HÜCRELERİ VE PRİMER NK HÜCRELERİÜZERİNDEKİ ETKİSİNİN ARAŞTIRILMASI, Araştırmacı, (Tamamlanma Tarihi :02.09.2025),
  52. TAŞTAN C., TÜBİTAK, Universal, Kullanıma Hazır Multi-spesifik Carnk92 Hücre Üretimi Ve Pre-klinik Etkinlik Çalışması, Araştırmacı, (Tamamlanma Tarihi :01.01.2022),
  53. TAŞTAN C., TÜBİTAK, Ülkemizde ve Dünyada Halk Sağlığını En Fazla Tehdit Eden HIV, HPV ve Influenza Kaynaklı Enfeksiyonlara Karşı Tanı Kitleri, İlaç Formülasyonları ve Aşı Geliştirilmesi, Araştırmacı, (Tamamlanma Tarihi :28.03.2021),

9. Administrative Duties

  1. Merkez Müdürü / Head of Resarch Center - TRGENMER (2021-Continues)
  2. Kurul Üyeliği / Board Member - FİHADEK (2024-Continues)
  3. Çalışma Grubu Üyelikleri / Research Group Membership - Nörogörüntüleme Çalışma Grubu (2021-Continues)
  4. Çalışma Grubu Üyelikleri / Research Group Membership - NPNörogenetik Çalışma Grubu (2021-Continues)

10. Scientific Memberships

  1. Aktif Üye (AACR ID: 1259544), American Association for Cancer Research(2023)
  2. (Genel Sekreter), Tedavisel Beyin Haritalama, Biyolojik Psikiyatri ve Nöroteknoloji Derneği(2022)
  3. The Society of Experimental Biology (SEBM)(2021)

11. Awards

  1. Üsküdar Üniversitesi Genç Bilim İnsanı Ödülü, Genç Bilim İnsanı Ödülü, (2023)
  2. BIO Türkiye International Biotechnology Congress, Sözlü Bildiri 3.lük Ödülü, (2023)
  3. Türk Hematoloji Derneği, Deneysel Hematoloji dalında Bildiri Ödülü, (2022)
  4. Gençlik ve Spor Bakanlığı, “Limitless Makers” (Sınır Tanımayan Çözümler) Programına sunduğu katkılarından ötürü Limitsizlik Nişanı, (2022)
  5. The Society of Experimental Biology (SEBM), The Experimental Biology and Medicine (EBM) Outstanding Reviewer Award, (2021)
  6. Doktorclub Awards, Türkiye Geneli Nadir Hastalıklar Genetik Tedavi Yarışması - HiDNA-RaDiChal ile Yılın Medikal Endüstri Ödülleri- Yılın Sosyal Sorumluluk Projesi ödülü, (2020)
  7. Sanofi-Pharmup Programı, Dijital Verilerin DNA'da Depolanmasına Yönelik HiDNA Girişimi, (2019)
  8. Kök Hücre ve Hücresel Tedaviler Derneği, Ord. Prof. Dr. Süreyya Tahsin Aygün Araştırma Ödülü (3. Kök Hücre ve Hücresel Tedaviler Kongresi), (2019)
  9. Deneysel Hematoloji Derneği, En İyi Sözlü Bildirim Ödülü (V. Uluslararası Katılımlı Deneysel Hematoloji Kongresi), (2018)

12. Coourses recently given

Academic Year Semester Course name Hours Number of Students
Theoretical Application
2023-2024 Spring Graduation Thesis (Undergraduate) - Group 2 0 0 10
Moleküler Hücre Biyolojisi (Undergraduate) - Group 2 3 0 66
Yapay Zeka ve Genetik (Undergraduate) - Group 2 3 0 146
Mezuniyet Tezi (Undergraduate) - Group 2 0 0 28
Fall Uygulamalı Proje Yönetimi II (Doctorate) - 2 Group 2 0 30
Proje (Undergraduate) - Group 2 0 0 26
Viroloji (Undergraduate) - Group 2 3 0 64
Graduation Project (Undergraduate) - Group 2 0 0 8
Mikrobiyoloji (Undergraduate) - Group 2 3 0 92

Created: 03.12.2024